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Text File  |  1995-03-04  |  1.2 KB  |  26 lines
  1. *************************
  2. * HCP repeats signature *
  3. *************************
  4.  
  5. The histidine-rich calcium-binding protein (HCP) of sarcoplasmic reticulum [1]
  6. may play a role in the  regulation of  calcium sequestration or release in the
  7. SR of skeletal and cardiac muscle. This protein is very acidic (31% of Asp and
  8. Glu) and rich in histidine (13%).  The sequence  of  HCP  contains  10  tandem
  9. repeats of  a 26 to 29 amino acid residues domain.  This domain starts with an
  10. invariant hexapeptide (HRHRGH),  followed by a stretch of acidic residues. The
  11. end of the domain consist of an almost invariant nonapeptide (STESDRHQA).  The
  12. highly acidic  central  cores of each repeat  are  likely  to  constitute  the
  13. calcium-binding sites of HCP.
  14.  
  15. The pattern we have developed comprises  the beginning  of the domain and part
  16. of the central acidic stretch.
  17.  
  18. -Consensus pattern: H-R-H-R-G-H-x(2)-[DE](7)
  19. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  20. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  21. -Last update: April 1990 / First entry.
  22.  
  23. [ 1] Hofmann S.L., Goldstein J.L., Orth K., Moomaw C.R., Slaughter C.A.,
  24.      Brown M.S.
  25.      J. Biol. Chem. 264:18083-18090(1989).
  26.